Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cds1P98191 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cds1P98191 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms