Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LystP97412 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LystP97412 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LystP97412 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LystP97412 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LystP97412 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LystP97412 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LystP97412 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LystP97412 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LystP97412 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LystP97412 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms