Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H3f3aP84244 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H3f3aP84244 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms