Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otx1P80205 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otx1P80205 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otx1P80205 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms