Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ufd1P70362 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms