Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx3P70354 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msx3P70354 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Msx3P70354 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms