Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smad1P70340 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms