Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp7P70280 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp7P70280 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms