Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actg1P63260 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actg1P63260 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms