Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrb3P63080 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms