Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uba52P62984 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uba52P62984 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms