Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm6P62313 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm6P62313 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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