Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lim2P56563 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lim2P56563 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lim2P56563 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lim2P56563 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms