Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd3P55096 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcd3P55096 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms