Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GemP55041 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GemP55041 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GemP55041 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GemP55041 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GemP55041 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GemP55041 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GemP55041 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GemP55041 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms