Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RabggtbP53612 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RabggtbP53612 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RabggtbP53612 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms