Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Map3k1P53349 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Map3k1P53349 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms