Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx3P50481 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx3P50481 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms