Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SftpdP50404 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SftpdP50404 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms