Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Hoxc13P50207 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hoxc13P50207 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxc13P50207 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms