Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcls1P49710 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcls1P49710 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms