Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ercc3P49135 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms