Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VdrP48281 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VdrP48281 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VdrP48281 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VdrP48281 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VdrP48281 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VdrP48281 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VdrP48281 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VdrP48281 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VdrP48281 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VdrP48281 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms