Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl5P47962 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl5P47962 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms