Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccr7P47774 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccr7P47774 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms