Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax9P47242 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax9P47242 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax9P47242 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms