Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx1-2P42580 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms