Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn1P35821 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms