Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ddit3P35639 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms