Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pola1P33609 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pola1P33609 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pola1P33609 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pola1P33609 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pola1P33609 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pola1P33609 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pola1P33609 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pola1P33609 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms