Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc5P32043 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc5P32043 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms