Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxa11P31311 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms