Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DcnP28654 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DcnP28654 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DcnP28654 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DcnP28654 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DcnP28654 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DcnP28654 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DcnP28654 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DcnP28654 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DcnP28654 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DcnP28654 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DcnP28654 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DcnP28654 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DcnP28654 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DcnP28654 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms