Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtmaP26350 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtmaP26350 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtmaP26350 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtmaP26350 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtmaP26350 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms