Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tap1P21958 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tap1P21958 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms