Protein–RNA interactions for Protein: P21126

Ubl4a, Ubiquitin-like protein 4A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4aP21126 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubl4aP21126 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubl4aP21126 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms