Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prim1P20664 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Prim1P20664 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim1P20664 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms