Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ms4a2P20490 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ms4a2P20490 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a2P20490 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms