Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifrd1P19182 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifrd1P19182 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms