Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Calb1P12658 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Calb1P12658 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Calb1P12658 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms