Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lamp1P11438 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lamp1P11438 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms