Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FlgP11088 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FlgP11088 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FlgP11088 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FlgP11088 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FlgP11088 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FlgP11088 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FlgP11088 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FlgP11088 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FlgP11088 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FlgP11088 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FlgP11088 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FlgP11088 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FlgP11088 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FlgP11088 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FlgP11088 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FlgP11088 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms