Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spp1P10923 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spp1P10923 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms