Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Schip1P0DPB4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Schip1P0DPB4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms