Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ndufb1P0DN34 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms