Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Eb1P04230 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Eb1P04230 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms