Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01680 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01680 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01680 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01680 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01680 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01680 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01680 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01680 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01680 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01680 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01680 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01680 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01680 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01680 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01680 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms