Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01679 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01679 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01679 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01679 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01679 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01679 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01679 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01679 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01679 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01679 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01679 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01679 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01679 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01679 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01679 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01679 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01679 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01679 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01679 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01679 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01679 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01679 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01679 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01679 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01679 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01679 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01679 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01679 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01679 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01679 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms