Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01678 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01678 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01678 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
P01678 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
P01678 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01678 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
P01678 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
P01678 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms