Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4aO89084 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4aO89084 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4aO89084 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4aO89084 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4aO89084 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4aO89084 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4aO89084 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4aO89084 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4aO89084 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde4aO89084 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms